تنوع ژنتیکی گله های پرورشی قزل آلای رنگین کمان (oncorhynchus mykiss) با استفاده از نشانگر ریزماهواره
thesis
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه صنعتی اصفهان - دانشکده منابع طبیعی
- author ابوالفتح علیپور
- adviser سالار درافشان احمد قاسمی
- Number of pages: First 15 pages
- publication year 1390
abstract
ماهی قزل آلای رنگین کمان (oncorhynchus mykiss) متعلق به خانواده آزادماهیان (salmonidae) مهمترین ماهی پرورشی سردآبی در ایران است. با توجه به اهمیت مطالعه تنوع ژنتیکی و ساختار جمعیت در مدیریت و انتخاب مولدین شایسته جهت تکثیر در کارگاه ها، تنوع ژنتیکی گله های پرورشی قزل آلای رنگین کمان با استفاده از روش ریزماهواره مورد مطالعه قرار گرفت. در این بررسی 30 قطعه ماهی از هر یک از گله های ایرانی، آمریکایی، اسپانیایی و فرانسوی از مراکز پرورش تهیه شدند. به منظور اجرای مطالعات مولکولی، استخراج دی.ان.ا به روش استات آمونیوم از بافت نرم باله دمی یا قسمتی از بدن انجام گرفت.کیفیت دی.ان.ا استخراج شده به وسیله الکتروفورز ژل 1% و رنگ آمیزی با اتیدیوم بروماید بررسی شد. واکنش pcr با استفاده از چهار جفت آغازگر ریزماهواره (omy77, omy325, omm1332 و omm1329) در دمای الحاق 58 -5/62 انجام شد. محصولات pcr روی ژل اکریلامید 12% الکتروفورز و به روش نیترات نقره رنگ آمیزی شد و نتایج حاصل از آنها با استفاده از نرم افزار genalex6 آنالیز شد. در مجموع تمامی آغازگرهای مورد استفاده چندشکلی بالایی نشان دادند. تعداد آلل مشاهده شده در تمامی جایگاه ها در گستره 16-8 عدد محاسبه شد. میانگین تعدادآلل مشاهده شده در گله ایرانی 75/10، آمریکایی 11، اسپانیایی 50/11 و فرانسوی 10 محاسبه شد. تعداد آلل موثر در تمام جایگاه ها در گستره 53/11-40/5 عدد بود. میانگین تعداد آلل موثر در گله ایرانی 43/7، آمریکایی 03/8، اسپانیایی 65/8 و فرانسوی 19/7 بود. به طور کلی دامنه باندی در جایگاه های omy77, omm1329, omy325 و omm1332 به ترتیب 178-102، 150-100، 198-122 و204-172 جفت باز بود. میانگین هتروزایگوسیتی مشاهده شده در گله ایرانی 591/0، آمریکایی 591/0، اسپانیایی 633/0 و فرانسوی 566/0 به دست آمد. میانگین هتروزایگوسیتی مورد انتظار در گله ایرانی 861/0، آمریکایی 868/0، اسپانیایی 879/0 و فرانسوی 854/0 بود. نتایج مولکولی انحراف ازتعادل هاردی-واینبرگ را 14 آزمون از 16 آزمون مورد بررسی (جایگاه*گله)، افزایش نسبی هتروزایگوسیتی مشاهده شده به هتروزایگوسیتی مورد انتظار در جایگاه omy325 گله ایرانی، جایگاه omy325 گله آمریکایی، جایگاه omy325 گله اسپانیایی و گله فرانسوی، تمایز ژنتیکی پایین بین گله ها (7%) و تنوع ژنتیکی بالای درون گله ها (93%) و وجود جریان ژنی قابل توجه بین چهار گله (07/16) را نشان داد. همچنین میزان شباهت و فاصله ژنتیکی بین گله ها به ترتیب از گستره 847/0-727/0 و 319/0-166/0 به دست آمد. آنالیز های مولکولی با ارزیابی تنوع ژنتیکی مطلوب درون هر گله قادر به تفکیک مناسب گله ها از یکدیگر بود. ترسیم نمودار شجره ای در چهار گله مورد بررسی براساس فاصله ژنتیکی (1972، 1978) nei و به روش upgma انجام گرفت. بر اساس نتایج حاصله نمونه های گله های آمریکایی، اسپانیایی و فرانسوی در یک شاخه و نمونه های گله ایرانی در شاخه ای جداگانه قرار گرفت. میزان fst 023/0 به دست آمد. میزان شاخص درون آمیزی (fis) در گله های ایرانی، آمریکایی، اسپانیایی و فرانسوی به ترتیب 329/0، 334/0، 295/0 و 343/0 به دست آمد. میزان تنوع ژنتیکی درون گله نمونه های اسپانیایی از دیگر گله ها بیشتر بود. با توجه به جدایی گله ایرانی از دیگر گله ها می توان عنوان نمود که برای انجام برنامه تلاقی دو گله جهت هیبریدگیری، بهترین برنامه تلاقی گله ایرانی با یکی دیگر از گله ها است.
similar resources
ساختار ژنتیکی قزل آلای رنگین کمان پرورشی Oncorhynchus mykiss اسپانیایی و آمریکایی
ماهی قزل آلای رنگین کمان (Oncorhynchus mykiss) مهمترین ماهی پرورشی سردآبی در ایران است. جمعیت پرورشی متفاوتی از کشورهای مختلف وارد ایران شده و در سراسر کشور مزارعی به تکثیر و پرورش آنها مبادرت میکنند. در این مطالعه ساختار ژنتیکی قزل آلای رنگین کمان اسپانیایی و آمریکایی با استفاده از چهار جفت نشانگر ریزماهواره و 30 عدد ماهی از هر جمعیت مورد مطالعه قرار گرفت. به طور کلی دامنه باندی در جایگاههای ...
full textبررسی تنوع ژنتیکی ماهی قزل آلای رنگین کمان با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره در مزارع پرورشی ایران
تعداد 64 نمونه از ماهی قزل الا (Onchorhynchus mykiss) از 3 مزرعه از استانهای مختلف کشور جمع آوری گردید. از هر نمونه 2 تا 3 گرم از باله دمی بریده و پس از تثبیت در الکل اتانول مطلق به آزمایشگاه منتقل گردید. DNA ژنومی نمونهها از بافت نرم باله ماهی به روش فنل- کلروفرم استخراج و سپس کمیت و کیفیت DNA استخراج شده با استفاده از اسپکتروفتومتر و الکتروفورز ژل آگارز 1 درصد تعیین شد. واکنش PCR با استفا...
full textبررسی تأثیر رقابت اسپرم بر تنوع ژنتیکی نتاج قزل آلای رنگین کمان (oncorhynchus mykiss) با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره
در این پژوهش، با استفاده از اختلافات موجود میان خصوصیات کیفی اسپرم مولدین قزل آلای رنگین کمان، تأثیر شاخص های: تعداد و مدت زمان تحرک اسپرم بر موفقیت رقابت پذیری اسپرم بررسی شد. برای اجرای آزمایش تعداد سه قطعه ماهی نر و یک قطعه مولد ماده نیاز بود که این مولدین از میان گله مولدین چهار ساله انتخاب شدند. نسبت لاروهای حاصل از مولدین نر مختلف با استفاده از تجزیه و تحلیل جایگاه های ریزماهواره (دو جایگ...
full textاثرات رقابت اسپرم بر تنوع ژنتیکی نتاج قزل آلای رنگین کمان با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره، ( oncorhynchus mykiss walbaum, 1972)
رقابت اسپرم زمانی رخ می دهد که اسپرم دو یا چند نر جهت بارورسازی توده ای از تخمک ها با هم رقابت کنند. این نوع انتخاب جنسی، به عنوان نیرویی شایع و مهم در تکامل بیولوژی تولید مثل جنس نر و و همچنین عامل تعیین کننده در قدرت تولیدمثلی نر مطرح می باشد. علی رغم اهمیت این موضوع، در ارتباط با جزئیات پدیده رقابت اسپرم اطلاعات معدودی وجود دارد. در این تحقیق، با استفاده از اختلافات موجود میان خصوصیات کیفی ا...
15 صفحه اولامکان تعیین جنسیت قزل آلای رنگین کمان (Oncorhynchus mykiss) با استفاده از نشانگرهای ملکولی
چکیده این تحقیق با هدف بررسی امکان تعیین جنسیت ماهی قزلآلای رنگینکمان از طریق غربالگری مولکولی به منظور ایجاد جمعیتهای تکجنسیت انجام شد. بدین منظور تعداد 35 نمونه از بافت بالة دمی ماهیان بالغ قزلآلای رنگینکمان بازار کرج، بهمنزلة نمونة آماری، تهیه شد و پس از استخراج DNA از نمونهها، تکثیر جایگاه نشانگرها انجام پذیرفت. واکنش زنجیرهای پلیمراز برای تکثیر نشانگرهای وابسته به جنس...
full textرخداد کبد چرب (Ceroidosis) در ماهیان پرورشی قزل آلای رنگین کمان(Oncorhynchus mykiss)
آزادماهیان به بیماری کبد چرب بسیار حساس بوده و در صورت تغذیه از جیره های حاوی اسید های چرب اشباع ، مقادیر بالای کربو هیدرات و مقادیر ناکافی آنتی اکسیدان هایی نظیر ویتامین E به این بیماری مبتلا می شوند. به دنبال کاهش اشتها ، عدم تعادل و تلفات در یکی از فارم های پرورش قزل آلای رنگین کمان در جاده هراز در زمستان 90، تعدادی نمونه جهت بررسی به آزمایشگاه انتقال یافت. در بررسی ظاهری ماهی ها، تی...
full textMy Resources
document type: thesis
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه صنعتی اصفهان - دانشکده منابع طبیعی
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023